Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPFP62306 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPFP62306 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms