Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2NP61088 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2NP61088 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms