Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB2AP61019 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB2AP61019 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms