Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms