Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBASH3AP57075 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms