Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSCP56915 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSCP56915 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSCP56915 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSCP56915 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSCP56915 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSCP56915 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSCP56915 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSCP56915 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms