Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PGGT1BP53609 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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