Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNA3P52797 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EFNA3P52797 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms