Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF138P52744 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF138P52744 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms