Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF2A1P52655 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2A1P52655 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms