Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCNKBP51801 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCNKBP51801 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCNKBP51801 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms