Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA2P51587 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRCA2P51587 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms