Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
SMARCA2P51531 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms