Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP5P45974 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP5P45974 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP5P45974 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP5P45974 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP5P45974 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP5P45974 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP5P45974 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP5P45974 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP5P45974 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms