Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA4P43681 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA4P43681 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms