Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms