Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPOP42166 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPOP42166 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPOP42166 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPOP42166 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMPOP42166 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPOP42166 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPOP42166 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPOP42166 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms