Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFSF9P41273 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms