Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 REG2YBR050C 1017 nt2.39□□□□□ -2.03
PGD1P40356 PIN3YPR154W 648 nt2.39□□□□□ -2.03
PGD1P40356 PBI1YPL272C 1554 nt2.39□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YIL169CYIL169C 2988 nt2.39□□□□□ -2.03
PGD1P40356 KEL2YGR238C 2649 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MON1YGL124C 1935 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 NUM1YDR150W 8247 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 NTO1YPR031W 2247 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 IZH1YDR492W 951 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 NIT3YLR351C 876 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YLR365WYLR365W 333 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MRPL33YMR286W 261 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 COS1YNL336W 1146 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MPD2YOL088C 834 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MUM2YBR057C 1101 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YPR078CYPR078C 1119 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 EBS1YDR206W 2655 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DSS1YMR287C 2910 nt2.38□□□□□ -2.03
PGD1P40356 HYP2YEL034W 474 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 PMI40YER003C 1290 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SAY1YGR263C 1275 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MAK16YAL025C 921 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 EMC2YJR088C 879 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YKR033CYKR033C 426 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YMR310CYMR310C 954 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 POS5YPL188W 1245 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 EPL1YFL024C 2499 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 AXL1YPR122W 3627 nt2.37□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MRD1YPR112C 2664 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 BNR1YIL159W 4128 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YDR133CYDR133C 336 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 AST2YER101C 1293 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DDI2YFL061W 678 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YGL152CYGL152C 678 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 PEX14YGL153W 1026 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YHL045WYHL045W 348 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 PAN5YHR063C 1140 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RSM26YJR101W 801 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SIC1YLR079W 855 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 HNT3YOR258W 654 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YPL035CYPL035C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 ACM1YPL267W 630 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YPR053CYPR053C 456 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MIP6YHR015W 1980 nt2.36□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RMD5YDR255C 1266 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SOL3YHR163W 750 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 THP2YHR167W 786 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 ATG27YJL178C 816 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RSM19YNR037C 276 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YOL024WYOL024W 519 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RPL33AYPL143W 324 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 ICR1ICR1 3199 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YDL199CYDL199C 2064 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 IKI3YLR384C 4050 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DSE4YNR067C 3354 nt2.35□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DIA2YOR080W 2199 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 MTL1YGR023W 1656 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 HRD1YOL013C 1656 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 CET1YPL228W 1650 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 CIN1YOR349W 3045 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 VHR2YER064C 1518 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YDL241WYDL241W 372 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 GRX2YDR513W 432 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 YIP5YGL161C 933 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RPL24BYGR148C 468 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DCG1YIR030C 735 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 DID4YKL002W 699 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 IMP4YNL075W 873 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 GPI2YPL076W 843 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 RGC1YPR115W 3252 nt2.34□□□□□ -2.03
PGD1P40356 SPF1YEL031W 3648 nt2.34□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PSD2YGR170W 3417 nt2.34□□□□□ -2.04
PGD1P40356 HUL5YGL141W 2733 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SGM1YJR134C 2124 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YDR290WYDR290W 330 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 NKP1YDR383C 717 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SMT3YDR510W 306 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MST27YGL051W 705 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TAN1YGL232W 870 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 POP6YGR030C 477 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 CFD1YIL003W 882 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 VMA5YKL080W 1179 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YLR290CYLR290C 834 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 KTI11YBL071W-A 249 nt2.33□□□□□ -2.04
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