Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMB10P40306 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMB10P40306 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms