Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FEN1P39748 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FEN1P39748 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FEN1P39748 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FEN1P39748 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms