Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LTBRP36941 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LTBRP36941 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LTBRP36941 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LTBRP36941 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms