Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT2P35908 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT2P35908 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT2P35908 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT2P35908 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT2P35908 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT2P35908 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms