Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYLC1P35663 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYLC1P35663 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms