Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NF2P35240 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NF2P35240 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NF2P35240 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NF2P35240 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NF2P35240 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NF2P35240 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NF2P35240 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NF2P35240 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NF2P35240 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NF2P35240 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NF2P35240 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NF2P35240 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms