Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 ARG2YJL071W 1725 nt3.91□□□□□ -1.78
NIC96P34077 ASC1YMR116C 960 nt3.91□□□□□ -1.78
NIC96P34077 NRK1YNL129W 723 nt3.91□□□□□ -1.78
NIC96P34077 TPO5YKL174C 1857 nt3.9□□□□□ -1.78
NIC96P34077 GRS2YPR081C 1857 nt3.9□□□□□ -1.78
NIC96P34077 MDM36YPR083W 1740 nt3.9□□□□□ -1.78
NIC96P34077 VPS33YLR396C 2076 nt3.9□□□□□ -1.78
NIC96P34077 CLB3YDL155W 1284 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SLU7YDR088C 1149 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 LOC1YFR001W 615 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 GOS1YHL031C 672 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ATG27YJL178C 816 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 NKP2YLR315W 462 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YLR416CYLR416C 399 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SRL1YOR247W 633 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 TOP1YOL006C 2310 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 FAS2YPL231W 5664 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 PDR12YPL058C 4536 nt3.9□□□□□ -1.79
NIC96P34077 BEM4YPL161C 1902 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ACE2YLR131C 2313 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 BRE4YDL231C 3378 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPS13YDR064W 456 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 DIG2YDR480W 972 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 PAU13YHL046C 363 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPL6BYLR448W 531 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 HHF1YBR009C 312 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ICY2YPL250C 411 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 DPH6YLR143W 2058 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 MNT4YNR059W 1743 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RTT109YLL002W 1311 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ARG5,6YER069W 2592 nt3.89□□□□□ -1.79
NIC96P34077 REF2YDR195W 1602 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SYO1YDL063C 1863 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SAF1YBR280C 1914 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPL1BYGL135W 654 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 PIR1YKL164C 1026 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPP0YLR340W 939 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPL1AYPL220W 654 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 CCM1YGR150C 2595 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 TMA108YIL137C 2841 nt3.88□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ATP25YMR098C 1839 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 NSE4YDL105W 1209 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RAV2YDR202C 1056 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SMT3YDR510W 306 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 COX2Q0250 756 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YHR180WYHR180W 492 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 IME1YJR094C 1083 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 TPK3YKL166C 1197 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ATP11YNL315C 957 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 INO4YOL108C 456 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YOL114CYOL114C 609 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 snR17asnR17a 333 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YCL020WYCL020W 1317 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 BIK1YCL029C 1323 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 VPS17YOR132W 1656 nt3.87□□□□□ -1.79
NIC96P34077 RPO31YOR116C 4383 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SYT1YPR095C 3681 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YFL015CYFL015C 495 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YIL171WYIL171W 330 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 IST3YIR005W 447 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YJL147CYJL147C 1149 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YMR181CYMR181C 465 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YNL013CYNL013C 378 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 IZH2YOL002C 954 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 VAM10YOR068C 345 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 APD1YBR151W 951 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 GSC2YGR032W 5688 nt3.86□□□□□ -1.79
NIC96P34077 GCR1YPL075W 2358 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 NDC80YIL144W 2076 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 TDA1YMR291W 1761 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YDL094CYDL094C 510 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YDR220CYDR220C 294 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 BUD25YER014C-A 462 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YGR039WYGR039W 312 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 PRP38YGR075C 729 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 GTT2YLL060C 702 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 MRPL16YBL038W 699 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 FSH3YOR280C 801 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YOR387CYOR387C 621 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YPL278CYPL278C 303 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 CMD1YBR109C 444 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 FUS2YMR232W 2034 nt3.85□□□□□ -1.79
NIC96P34077 FMP25YLR077W 1752 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SRP68YPL243W 1800 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 FMP46YKR049C 402 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 YKR051WYKR051W 1257 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 ATG38YLR211C 681 nt3.84□□□□□ -1.79
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