Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SP100P23497 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SP100P23497 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP100P23497 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SP100P23497 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SP100P23497 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP100P23497 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP100P23497 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP100P23497 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms