Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AMPD1P23109 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms