Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALB2P22676 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALB2P22676 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALB2P22676 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms