Protein–RNA interactions for Protein: P21980

TGM2, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM2P21980 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TGM2P21980 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGM2P21980 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TGM2P21980 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM2P21980 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGM2P21980 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGM2P21980 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGM2P21980 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms