Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI3P19429 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNNI3P19429 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms