Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DESP17661 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DESP17661 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DESP17661 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DESP17661 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DESP17661 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DESP17661 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DESP17661 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DESP17661 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DESP17661 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms