Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYN1P17600 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYN1P17600 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYN1P17600 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYN1P17600 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYN1P17600 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms