Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA1P17302 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA1P17302 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA1P17302 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA1P17302 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA1P17302 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms