Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDGFRAP16234 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDGFRAP16234 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms