Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB1P16220 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB1P16220 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB1P16220 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB1P16220 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CREB1P16220 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms