Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCHL3P15374 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCHL3P15374 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms