Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GP1BBP13224 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GP1BBP13224 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms