Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD28P10747 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD28P10747 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD28P10747 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD28P10747 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms