Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBSLP0DN79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms