Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD3P0DMS9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms