Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf88P0DMB2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C8orf88P0DMB2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms