Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD2P0DJD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms