Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD7P09564 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD7P09564 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD7P09564 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD7P09564 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD7P09564 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD7P09564 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms