Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRCP08575 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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