Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRPRAP08240 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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