Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLBP06746 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLBP06746 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLBP06746 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLBP06746 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLBP06746 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLBP06746 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLBP06746 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms