Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDN1P05305 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDN1P05305 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDN1P05305 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDN1P05305 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms