Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTNP04004 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTNP04004 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTNP04004 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTNP04004 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTNP04004 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTNP04004 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTNP04004 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTNP04004 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTNP04004 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTNP04004 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTNP04004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms