Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNAP02545 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMNAP02545 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMNAP02545 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMNAP02545 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMNAP02545 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNAP02545 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms